Лучше по отдельности, это я вам говорю исходя из своего опыта. Потому что со временем у вас будут добавляться проекты, которые при стандартной панели хостера реализовать не получится, так и так придется брать отдельную панель управления. Поэтому проще сразу
сюда зайти и решить этот вопрос. Тем более, что отдельная панель это возможность обратиться в поддержку.